Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms