Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn5Q9WU28 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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