Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a3Q9QZB6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a3Q9QZB6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms