Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcsk1nQ9QXV0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms