Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms