Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms