Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms