Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mrpl39Q9JKF7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl39Q9JKF7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl39Q9JKF7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl39Q9JKF7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms