Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS9

Vmn1r56, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r56Q9EPS9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms