Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Tspan4Q9DCK3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Tspan4Q9DCK3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Tspan4Q9DCK3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Tspan4Q9DCK3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Tspan4Q9DCK3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Tspan4Q9DCK3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Tspan4Q9DCK3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Tspan4Q9DCK3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Tspan4Q9DCK3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Tspan4Q9DCK3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Tspan4Q9DCK3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tspan4Q9DCK3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tspan4Q9DCK3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tspan4Q9DCK3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tspan4Q9DCK3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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