Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms