Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chmp4cQ9D7F7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms