Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ribc2Q9D4Q1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ribc2Q9D4Q1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms