Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pabpc6Q9D4E6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms