Protein–RNA interactions for Protein: Q9D496

4930548H24Rik, RIKEN cDNA 4930548H24, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930548H24RikQ9D496 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930548H24RikQ9D496 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930548H24RikQ9D496 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930548H24RikQ9D496 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930548H24RikQ9D496 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930548H24RikQ9D496 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930548H24RikQ9D496 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930548H24RikQ9D496 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930548H24RikQ9D496 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930548H24RikQ9D496 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930548H24RikQ9D496 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930548H24RikQ9D496 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930548H24RikQ9D496 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930548H24RikQ9D496 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930548H24RikQ9D496 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930548H24RikQ9D496 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930548H24RikQ9D496 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms