Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W5

Lrrc71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc71Q9D3W5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc71Q9D3W5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms