Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Batf3Q9D275 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Batf3Q9D275 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms