Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms