Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mgme1Q9CXC3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms