Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR83

Rbm18, Probable RNA-binding protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm18Q9CR83 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm18Q9CR83 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm18Q9CR83 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm18Q9CR83 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm18Q9CR83 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm18Q9CR83 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm18Q9CR83 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms