Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tma16Q9CR02 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tma16Q9CR02 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms