Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mri1Q9CQT1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms