Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab5aQ9CQD1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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