Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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