Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2a1Q99PM3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms