Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brms1Q99N20 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms