Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dnajb11Q99KV1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dnajb11Q99KV1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dnajb11Q99KV1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dnajb11Q99KV1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms