Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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TrabdQ99JY4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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TrabdQ99JY4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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TrabdQ99JY4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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TrabdQ99JY4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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TrabdQ99JY4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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TrabdQ99JY4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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TrabdQ99JY4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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TrabdQ99JY4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrabdQ99JY4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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