Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Smim11aQ99J19 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Smim11aQ99J19 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Smim11aQ99J19 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Smim11aQ99J19 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim11aQ99J19 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Smim11aQ99J19 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Smim11aQ99J19 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim11aQ99J19 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Smim11aQ99J19 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim11aQ99J19 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim11aQ99J19 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim11aQ99J19 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Smim11aQ99J19 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Smim11aQ99J19 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim11aQ99J19 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms