Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad3Q925I1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms