Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim7Q923T7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim7Q923T7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms