Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi2Q920Q6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms