Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms