Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Pde6cQ91ZQ1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Pde6cQ91ZQ1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Pde6cQ91ZQ1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Pde6cQ91ZQ1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Pde6cQ91ZQ1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Pde6cQ91ZQ1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Pde6cQ91ZQ1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Pde6cQ91ZQ1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Pde6cQ91ZQ1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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Pde6cQ91ZQ1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Pde6cQ91ZQ1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Pde6cQ91ZQ1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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