Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE42

Ankrd49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd49Q8VE42 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ankrd49Q8VE42 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd49Q8VE42 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd49Q8VE42 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd49Q8VE42 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd49Q8VE42 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd49Q8VE42 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms