Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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GcaQ8VC88 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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GcaQ8VC88 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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GcaQ8VC88 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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GcaQ8VC88 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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GcaQ8VC88 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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GcaQ8VC88 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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GcaQ8VC88 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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GcaQ8VC88 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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GcaQ8VC88 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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GcaQ8VC88 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GcaQ8VC88 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms