Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW8

Ttc36, Tetratricopeptide repeat protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc36Q8VBW8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc36Q8VBW8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms