Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk5rap2Q8K389 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk5rap2Q8K389 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms