Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Sash3Q8K352 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sash3Q8K352 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms