Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho1Q8K285 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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