Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc63Q8CDV6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms