Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms