Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ6

UPF0505 protein C16orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BWQ6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Q8BWQ6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BWQ6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BWQ6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BWQ6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BWQ6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BWQ6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BWQ6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms