Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops7bQ8BV13 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops7bQ8BV13 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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