Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Prpf18Q8BM39 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Prpf18Q8BM39 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Prpf18Q8BM39 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Prpf18Q8BM39 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Prpf18Q8BM39 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Prpf18Q8BM39 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Prpf18Q8BM39 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf18Q8BM39 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms