Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc172Q810N9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms