Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc42bpbQ7TT50 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms