Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dsg1bQ7TSF1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1bQ7TSF1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms