Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rph3alQ768S4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rph3alQ768S4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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