Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms